More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1839 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 261 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2731  Helix-turn-helix, AraC domain protein  43.97 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  29.69 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  28.77 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  28.15 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2432  transcriptional regulator, AraC family  27.43 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28452  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 264 aa  72  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  30.7 
 
 		 273 aa  72  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1998  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.19 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  45.74 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0671  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  32.46 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  32.02 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  27.23 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3263  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.534649  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3204  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19869  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  29.15 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2201  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3822  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 282 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3877  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2303  AraC family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1743  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295048  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  38.26 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  34.85 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  29.18 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  33.04 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  29.77 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0565  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 151 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  37.74 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 151 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 143 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 143 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09710  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.71 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.966936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1753  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 322 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143469  normal  0.226934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15970  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 337 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 143 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  42.67 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 259 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  33.98 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3445  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 314 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3242  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 314 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0373  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 321 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 306 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2903  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 314 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2186  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 314 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>