More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5394 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  37.45 
 
 		 262 aa  121  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3351  Helix-turn-helix, AraC domain protein  36.56 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  35.68 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  35.47 
 
 		 260 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 260 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  31.95 
 
 		 269 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  28.99 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  33.92 
 
 		 287 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  40.31 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  27.16 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  39.6 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 288 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  46.84 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  28.64 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  31.03 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4276  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 279 aa  62  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1743  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295048  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2303  AraC family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  32.38 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  35.58 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02039  putative DNA-binding protein  27.75 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2370  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0671  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.09 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5828  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  43.42 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3822  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 282 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3204  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19869  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2432  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.32 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4352  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00646909  normal  0.121153 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.95 
 
 		 415 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15970  transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  27.35 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0565  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 286 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3877  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 282 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1151  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 265 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  26.94 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.44 
 
 		 310 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 517 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  25.11 
 
 		 278 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.44 
 
 		 310 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2201  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 275 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2746  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1998  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.89 
 
 		 258 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 265 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  28.51 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5371  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 		 326 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2427  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6130  transcriptional regulator, AraC family  38.2 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.32 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3263  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.534649  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1112  transcriptional regulator, AraC family  38.16 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  25.11 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>