More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3684 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  555  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  95.38 
 
 		 260 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  95.38 
 
 		 260 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  77.46 
 
 		 278 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  72.43 
 
 		 256 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  73.97 
 
 		 256 aa  346  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  67.49 
 
 		 257 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  67.49 
 
 		 257 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  40.68 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  43.51 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  35.98 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  33.48 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  37.33 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  30.08 
 
 		 247 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  35.06 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  31.44 
 
 		 234 aa  89.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  33.92 
 
 		 229 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3351  Helix-turn-helix, AraC domain protein  34.29 
 
 		 226 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 221 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  34.51 
 
 		 221 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  51.95 
 
 		 267 aa  85.9  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02039  putative DNA-binding protein  28.33 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2303  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0671  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3822  AraC family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  43.18 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3877  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1743  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295048  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  33.19 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  28.1 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2432  transcriptional regulator, AraC family  27.65 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2201  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3263  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.534649  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15970  transcriptional regulator, AraC family  39.44 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1998  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.46 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  41.33 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  33.6 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3204  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19869  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  33.86 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6130  transcriptional regulator, AraC family  44.3 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  30.97 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3418  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 97 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 351 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8405  transcriptional regulator, AraC family  40.7 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 143 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 131 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 		 296 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  40.96 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 151 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2462  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 360 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  35.92 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 143 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  34.72 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 143 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  35.63 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  32.1 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0681  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 356 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2731  Helix-turn-helix, AraC domain protein  42.31 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2506  transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  37.93 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  35.78 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1199  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33488  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0730  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000385534  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 357 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1643  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>