More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3351 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3351  Helix-turn-helix, AraC domain protein  100 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  35.46 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 278 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  32.65 
 
 		 257 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  34.29 
 
 		 260 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 260 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  33.06 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  36.63 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02039  putative DNA-binding protein  26.34 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  27.35 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.75 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2858  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141433  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  34 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 270 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6130  transcriptional regulator, AraC family  40.7 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  37.66 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 322 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 284 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  34.52 
 
 		 791 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  28.84 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2141  two component AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  35 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 427 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 357 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 361 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 517 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0279  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 		 401 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 338 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  38.82 
 
 		 308 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 513 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 355 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 293 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 288 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 393 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 300 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 300 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 357 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 357 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 318 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 542 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 281 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  32.35 
 
 		 432 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 432 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0374  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 336 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 338 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 277 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 432 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 432 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  24.04 
 
 		 538 aa  52.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 432 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>