More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4554 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  81.03 
 
 		 256 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  76.38 
 
 		 278 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  71.6 
 
 		 260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  71.6 
 
 		 260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  72.43 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  42.05 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  41.42 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  36.02 
 
 		 264 aa  128  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  36.1 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  34.96 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  29.05 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  33.47 
 
 		 221 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  57.14 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  31.91 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 221 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3351  Helix-turn-helix, AraC domain protein  32.64 
 
 		 226 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3822  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3877  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02039  putative DNA-binding protein  26.78 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2303  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1743  AraC family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295048  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  42.05 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  30.57 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0671  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  28.45 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15970  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2432  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3204  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19869  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1998  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  30.77 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6130  transcriptional regulator, AraC family  43.04 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8405  transcriptional regulator, AraC family  40.22 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.17 
 
 		 415 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 188 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 299 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 313 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 143 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 271 aa  52  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3263  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.534649  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2201  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  33.63 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 143 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 143 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 151 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 		 668 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2462  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6432  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2506  transcriptional regulator, AraC family  21.45 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 131 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  37.25 
 
 		 279 aa  49.3  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 289 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 276 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 264 aa  48.9  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 311 aa  48.9  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.22 
 
 		 310 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  30.59 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4575  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 326 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 329 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.22 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  32.93 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0730  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000385534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  33.75 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 151 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  22.73 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  34.17 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  33.75 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2746  transcriptional regulator, AraC family  36.49 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  31.94 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  18.4 
 
 		 542 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.11 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>