203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1743 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1743  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  577  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295048  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  29.84 
 
 		 268 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  42.55 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  44.3 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  40.96 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  39.76 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  41.77 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  39.74 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0671  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2432  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  39.47 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3204  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19869  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2201  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3263  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.534649  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  37.33 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  38.82 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  40 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  35.64 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1998  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.71 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2303  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3877  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  34.67 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3822  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 223 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02039  putative DNA-binding protein  34.25 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0878  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776666  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15970  transcriptional regulator, AraC family  30.99 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193936 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 131 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4671  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2146  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3940  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.423213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3914  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1958  helix-turn-helix domain-containing protein  26.73 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3827  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2262  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4563  transcriptional regulator, AraC family  26.39 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  35.44 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8405  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3317  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 327 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1968  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 143 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3833  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 327 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.699646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  27.16 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 151 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  41.25 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  26.9 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 337 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1151  helix-turn-helix domain-containing protein  31.46 
 
 		 265 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3351  Helix-turn-helix, AraC domain protein  29.33 
 
 		 226 aa  46.2  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 143 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 143 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0285  transcriptional regulator, AraC family  22.28 
 
 		 269 aa  46.2  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000546061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2506  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 318 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 312 aa  45.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1012  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0565  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0973  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.69 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0046  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 131 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6130  transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.65 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>