More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0046 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0046  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
131 aa  270  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  45.28 
 
 
131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6584  AraC family transcriptional regulator  45.28 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  49.46 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 
151 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 
143 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 
143 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1502  AraC family transcriptional regulator  47.87 
 
 
115 aa  86.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182478  normal  0.0194008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3070  helix-turn-helix domain-containing protein  40.18 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362329  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  38 
 
 
280 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 
273 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 
279 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  44.57 
 
 
290 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 
306 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  40.37 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  39.45 
 
 
282 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0792  AraC family transcriptional regulator  47.83 
 
 
163 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 
274 aa  71.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 
284 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  41.3 
 
 
291 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 
287 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
285 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
300 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  41.76 
 
 
291 aa  70.1  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  43.04 
 
 
277 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6083  transcriptional regulator, AraC family  42.15 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.864918 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0973  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  43.43 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  41.76 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  37.74 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  43.96 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2369  transcriptional regulator  39.56 
 
 
368 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  41.76 
 
 
277 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  32.63 
 
 
280 aa  68.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 
278 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 
280 aa  67.4  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 
281 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  39.78 
 
 
278 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 
299 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 
281 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  42.68 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  42.68 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  41.84 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  42.39 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  41.46 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 
304 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  32.35 
 
 
255 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 
303 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
277 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 
277 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 
257 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 
279 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 
300 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 
288 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
291 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 
332 aa  64.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 
291 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
278 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
285 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 
269 aa  63.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 
291 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  42.17 
 
 
297 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 
309 aa  62.8  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 
278 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 
291 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
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NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 
295 aa  62.8  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal 
 
 
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NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  39 
 
 
264 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
273 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0671245 
 
 
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NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 
285 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 
278 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 
298 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal 
 
 
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NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 
293 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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