More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5753 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 287 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3877  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  44.71 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  48.05 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3822  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  30.45 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  45.83 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  31.19 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1743  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295048  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  37.37 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  35.64 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0671  AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  40.28 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2432  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 542 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3070  helix-turn-helix domain-containing protein  42.31 
 
 		 131 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362329  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  38.96 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  29.26 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6584  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  38.75 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  36.99 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2746  transcriptional regulator, AraC family  25.15 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  34.18 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3204  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19869  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  28.12 
 
 		 529 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15970  transcriptional regulator, AraC family  22.54 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>