279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0213 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  31.47 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 260 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  30.38 
 
 		 260 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  29.36 
 
 		 287 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3351  Helix-turn-helix, AraC domain protein  31.19 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  30.4 
 
 		 264 aa  85.1  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  28.44 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  43.21 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2303  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  24.69 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  30.28 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  28.63 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02039  putative DNA-binding protein  24.44 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  38.82 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  45.45 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15970  transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  25.32 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3822  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  35.24 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3877  transcriptional regulator, AraC family  31.22 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  38.75 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1998  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.8 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  35.38 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 311 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 278 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 278 aa  52  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 306 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 282 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 294 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5154  helix-turn-helix domain-containing protein  31.63 
 
 		 120 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 123 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2973  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 127 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5244  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 134 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  26.46 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1743  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295048  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.32 
 
 		 415 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2432  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28452  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6130  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2766  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 328 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  30.56 
 
 		 314 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 275 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3520  helix-turn-helix domain-containing protein  32.52 
 
 		 322 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 284 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 284 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 301 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 301 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 301 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 257 aa  48.9  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 276 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 291 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 291 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 257 aa  48.5  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 316 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 300 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 303 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 262 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2506  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 		 303 aa  48.5  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 316 aa  48.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  36.62 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  28.85 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 313 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>