More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2373 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  39.9 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  32.37 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 278 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  30.54 
 
 		 262 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  31.88 
 
 		 260 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 260 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  31.44 
 
 		 287 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  27.83 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3351  Helix-turn-helix, AraC domain protein  32.89 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  30.94 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  29.33 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  25.41 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  33.87 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  36.63 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  34.51 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1004  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2303  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  36.04 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000327  transcriptional regulator AraC family  28.68 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000791228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  30.43 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2432  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02039  putative DNA-binding protein  25.21 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 351 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0278  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  29.47 
 
 		 299 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2462  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1272  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 350 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.702716  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2105  putative sigma54 specific transcriptional regulator  35.51 
 
 		 497 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.619214  normal  0.0553697 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  25.74 
 
 		 316 aa  52  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2201  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 275 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  33.68 
 
 		 387 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  22.45 
 
 		 308 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 299 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  36.04 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 345 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3564  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 325 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2210  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 325 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3263  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.534649  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0851  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0269486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1352  helix-turn-helix domain-containing protein  27.72 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.436375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0885  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 277 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 355 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 360 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 357 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2357  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 332 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 360 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 281 aa  48.9  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  26.13 
 
 		 296 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0671  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 281 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 296 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2921  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 317 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 		 297 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 357 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.58 
 
 		 1396 aa  48.5  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0818  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 293 aa  48.9  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 357 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  48.5  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  33 
 
 		 279 aa  48.5  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  32.5 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>