162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0278 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0278  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0330  AraC family transcriptional regulator  55.42 
 
 		 242 aa  214  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0215  transcriptional regulator, AraC family  56.43 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0200  AraC family transcriptional regulator  55.6 
 
 		 233 aa  178  9e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  32.23 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  31.84 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  31.4 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0312  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  28.41 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  30.62 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  31.54 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  31.54 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0910  helix-turn-helix, AraC type  28.51 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  26.09 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  21.94 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1820  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.167781  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4886  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  23.92 
 
 		 240 aa  62  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  29.29 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  30.77 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0392  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  36.36 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  20.7 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  21.82 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2618  hypothetical protein  36.11 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2470  hypothetical protein  36.11 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 335 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3696  helix-turn-helix domain-containing protein  27.92 
 
 		 188 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 325 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  20.59 
 
 		 270 aa  52.4  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  28.28 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 328 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  20.76 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  35.8 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  34.07 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000110  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.84 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827796  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 437 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  30.1 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1966  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.327518  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1540  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 319 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047582  hitchhiker  0.00155056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 342 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0285  transcriptional regulator, AraC family  21.36 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000546061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 327 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 340 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 324 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  19.33 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 375 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7867  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1536  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 359 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7106  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 304 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  28.71 
 
 		 300 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 324 aa  45.4  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>