More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4881 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  62.86 
 
 		 255 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  42.63 
 
 		 255 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  40.23 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  33.2 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  29.46 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  29.46 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 263 aa  99  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  31.35 
 
 		 255 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  26.5 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  30.9 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  31.2 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1820  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.167781  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  28.82 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  29.79 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28660  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.52 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  30.33 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  31.62 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2748  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 231 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  46.74 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 344 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  35.42 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  24 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4999  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2730  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2700  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2744  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  29.24 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  39.74 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0278  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 519 aa  62.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>