More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4999 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4999  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  24.28 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  26.25 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  25.42 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2470  hypothetical protein  26.75 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2618  hypothetical protein  26.75 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  45.98 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  26.64 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  24.08 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0910  helix-turn-helix, AraC type  27.31 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  34.75 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  40.22 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  26.56 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  24.08 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  42.31 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4654  transcriptional regulator  25.81 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53090  transcriptional regulator  25.4 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2677  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  39.53 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1856  transcriptional regulator, AraC family  27.39 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0387007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  38.75 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.89 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0847  AraC family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2380  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0838291  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  44.93 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  41.33 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  32.21 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  34.74 
 
 		 310 aa  62  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  39.13 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6177  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0365179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  36.28 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  34.45 
 
 		 144 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0050  thermoregulatory protein LcrF  37.5 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.24501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 1201 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  24.05 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4722  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  23.23 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  24.05 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>