More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001016 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  100 
 
 		 270 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  91.11 
 
 		 270 aa  517  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  74.54 
 
 		 287 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  45.75 
 
 		 259 aa  234  9e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  38.06 
 
 		 250 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  37.25 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  33.07 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 255 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  29.73 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 255 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  28.69 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1820  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 248 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.167781  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  25.2 
 
 		 282 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  26.25 
 
 		 248 aa  86.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  24.36 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  27.9 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2748  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  30.54 
 
 		 346 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 204 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  26.05 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  26.21 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4153  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  39.78 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  25.21 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3086  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000257264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3030  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2976  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00165868  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3328  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1984  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  27.89 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3298  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  27.98 
 
 		 322 aa  75.5  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3306  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  37.23 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  28.74 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.16 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  34.26 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  34.96 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>