More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1747 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0910  helix-turn-helix, AraC type  37.39 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  34.58 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  34.45 
 
 		 263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  32.94 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 254 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0330  AraC family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  28.74 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  26.07 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  24.78 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 263 aa  72  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  26.79 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3520  helix-turn-helix domain-containing protein  37.74 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  28.74 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1820  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.167781  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  28.86 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0278  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2262  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1958  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  38.61 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  40.43 
 
 		 345 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  32.52 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  38.82 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0392  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  28.46 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  35.92 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  23.85 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  37.35 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 300 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0050  thermoregulatory protein LcrF  35.96 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.24501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  24.29 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  0.0000000035636 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2344  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3418  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3411  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4999  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0891  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0541662  normal  0.561597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  24.29 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  39.76 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  33.09 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1219  transcriptional regulator, AraC family  35.59 
 
 		 492 aa  62.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.627471  normal  0.0317838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.04 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 188 aa  62  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 289 aa  62  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 291 aa  62  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 320 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  30.94 
 
 		 278 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 332 aa  61.6  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 320 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2748  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3608  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0804414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  36.78 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>