More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22580 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  94.49 
 
 		 254 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  63.92 
 
 		 254 aa  317  9e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1820  AraC family transcriptional regulator  67.34 
 
 		 248 aa  297  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.167781  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 257 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  57.94 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  57.09 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  57.94 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  37.8 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 263 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  38.19 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  35.56 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  37.4 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  35.1 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  33.33 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  30.99 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  30.17 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  34.36 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  27.62 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  33.6 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  33.19 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  34.01 
 
 		 231 aa  86.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  42.86 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  36.72 
 
 		 1201 aa  75.5  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2748  AraC family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0910  helix-turn-helix, AraC type  28.63 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  36.28 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  33.96 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 323 aa  72  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4458  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0851  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  41.28 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0587  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0551242  normal  0.259692 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  38.68 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3696  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4886  transcriptional regulator, AraC family  34.87 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0382  transcriptional regulator, AraC family  42.53 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0339  transcriptional regulator, AraC family  40.23 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2057  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2576  AraC-like transcriptional regulator  37.25 
 
 		 313 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.289552 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  38.32 
 
 		 323 aa  68.6  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5912  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4929  transcriptional regulator, AraC family  45.57 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202383  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1753  AraC family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143469  normal  0.226934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  32.68 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2175  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 281 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  34.57 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0312  AraC family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2797  transcriptional regulator  39.77 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  33.65 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0610  helix-turn-helix domain-containing protein  38.04 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  38.3 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  20.66 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0050  thermoregulatory protein LcrF  31.78 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.24501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0153  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  33.06 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4999  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3242  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0373  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3445  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0178  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309128  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2903  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>