More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6428 on replicon NC_010517
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  490  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  99.59 
 
 		 243 aa  487  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  35.44 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 		 240 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  30.25 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  30.25 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0910  helix-turn-helix, AraC type  30.22 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  25.1 
 
 		 270 aa  85.9  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  30.47 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  25.1 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  27.95 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  26.07 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  30.49 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  26.72 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  41.23 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  24.78 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3696  helix-turn-helix domain-containing protein  37.14 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  29.44 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1820  AraC family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.167781  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2695  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4326  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  23.97 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2748  AraC family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  30.23 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0591  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 279 aa  65.1  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 278 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2343  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  39.55 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  40.95 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  32.23 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4073  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4185  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  38.04 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 281 aa  62  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 295 aa  62  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3111  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.33 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406543  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  36.09 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  34.34 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  36.52 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  23.2 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  35.29 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0330  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  40.86 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2797  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>