More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4042 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  96.65 
 
 		 239 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0910  helix-turn-helix, AraC type  39.33 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 		 231 aa  116  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  33.6 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 254 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 257 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  33.05 
 
 		 250 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2470  hypothetical protein  27.2 
 
 		 251 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  32.63 
 
 		 250 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2618  hypothetical protein  27.2 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  29.8 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4999  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  30.9 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  45.65 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  24.45 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  30.52 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1820  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.167781  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  24.35 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3520  helix-turn-helix domain-containing protein  34.93 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  41 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4731  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.944783  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  44.94 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  44.79 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1911  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3411  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2344  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3418  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  34.9 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 337 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  35.07 
 
 		 337 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  37.11 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1536  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  30.83 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 485 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 550 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3418  AraC family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 97 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  23.29 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  40.22 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5544  transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258636  normal  0.142482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>