More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4427 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 257 aa  535  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  35.41 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  34.62 
 
 		 270 aa  185  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 287 aa  182  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  37.2 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  36.8 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  34.4 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  29.48 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  27.2 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 304 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 254 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 282 aa  88.6  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1820  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.167781  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  27.53 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  27.53 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  27.69 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 305 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  28.17 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  27.38 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  44.21 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  40.4 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1172  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.324704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  25.1 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  37.63 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  33.33 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0589  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 300 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 291 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  42.35 
 
 		 305 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  26.38 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1981  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.382238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0392  AraC family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 234 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 151 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0682  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0973  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 143 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>