More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2748 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2748  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 275 aa  568  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0205  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  27.24 
 
 		 259 aa  92.4  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  27.03 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  27.03 
 
 		 250 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 255 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 255 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  26.12 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  24.58 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  25.51 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  24.79 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  27.2 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 254 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 259 aa  72  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  38.04 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  22.04 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00274  transcriptional regulator, AraC family protein  28 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3601  response regulator receiver domain-containing protein  37.97 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00477  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  22.27 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  36.46 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  21.49 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  35.23 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  34.23 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4441  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.440571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4074  helix-turn-helix domain-containing protein  29.86 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  37.86 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  23.46 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  25.58 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  34 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  31.1 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0392  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0116  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  28.46 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  20.82 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  35.44 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4555  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  27.53 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  35.42 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 678 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>