More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0392 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0392  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  464  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 287 aa  95.1  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 257 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 257 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 257 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  30.16 
 
 		 255 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 255 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 291 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  40.65 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  25.54 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  22.55 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  42.22 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3711  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  43.9 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  23.5 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2748  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 275 aa  75.1  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  37.7 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0330  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  23.5 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0068  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  37.7 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0059  AraC family transcription regulator  39 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0070  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0284  AraC family transcription regulator  39 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2727  AraC family transcription regulator  39 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  40.91 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3481  transcriptional regulator  39 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1826  AraC/XylS family transcription factor  39 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  40.52 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  29.22 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  34.48 
 
 		 302 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  26.13 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 300 aa  72  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1303  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 129 aa  72  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.239353  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  26.8 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  32.63 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  29.08 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0278  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0910  helix-turn-helix, AraC type  26.67 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  26.45 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  19.84 
 
 		 296 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  27.43 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  30.17 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  26.45 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  41.94 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>