More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0205 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0205  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 231 aa  480  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517916  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2748  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 275 aa  154  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  25.54 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  25.54 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.16 
 
 		 291 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  23.16 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 290 aa  62  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00274  transcriptional regulator, AraC family protein  27.52 
 
 		 284 aa  62  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.44 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.88 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 176 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  31.37 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  29.47 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4477  AraC family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  30.48 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  34.07 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1638  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.33 
 
 		 504 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  25.53 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  27.18 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4555  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 332 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1108  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  27.04 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110935  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  25 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1433  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000646594 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0879  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000031891  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3086  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000257264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3030  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3298  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3328  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0990  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 779 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  35 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  30.61 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 329 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 300 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4441  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.440571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  34.09 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4074  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 332 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  27.18 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  31.11 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 332 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3295  transcriptional regulator, AraC family  25.41 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>