More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1108 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1108  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  100 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110935  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  82.92 
 
 		 334 aa  410  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  76.57 
 
 		 331 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  76.79 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  76.79 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  76.79 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  76.37 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  76.79 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  75.95 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  75.95 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  74.89 
 
 		 332 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  74.89 
 
 		 332 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  74.89 
 
 		 332 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  74.89 
 
 		 332 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  74.89 
 
 		 332 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  74.89 
 
 		 332 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  74.89 
 
 		 332 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3448  AraC family transcriptional regulator  71.06 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  66.67 
 
 		 332 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1614  transcriptional regulator  66.53 
 
 		 332 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  55.74 
 
 		 324 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 341 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 371 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 371 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 341 aa  231  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  53.85 
 
 		 371 aa  231  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4498  AraC family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 340 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5023  AraC family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4823  transcriptional regulator  53.91 
 
 		 338 aa  228  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3304  AraC family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0827  AraC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1007  AraC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 365 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  53.74 
 
 		 343 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0739  AraC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 365 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1869  AraC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1980  AraC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433985  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0711  AraC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0469  AraC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 369 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2105  AraC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 421 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  47.23 
 
 		 401 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5062  transcriptional regulator, AraC family  53.3 
 
 		 331 aa  221  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652687  normal  0.0215007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  52.86 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  45.74 
 
 		 375 aa  209  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  45.73 
 
 		 367 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 367 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  46.29 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 353 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 368 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  44.84 
 
 		 368 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 339 aa  197  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  44.84 
 
 		 368 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  44.84 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  44.21 
 
 		 367 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  43.78 
 
 		 367 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  44.39 
 
 		 367 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 334 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  42.36 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0489  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 336 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 338 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 314 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 344 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  39.48 
 
 		 324 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  39.21 
 
 		 339 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 361 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  40.79 
 
 		 326 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  39.21 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 361 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 332 aa  178  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 332 aa  178  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  40 
 
 		 325 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 314 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 331 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 314 aa  175  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  37.72 
 
 		 337 aa  174  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 315 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  38.63 
 
 		 334 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 315 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  40.69 
 
 		 343 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  39.82 
 
 		 336 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 336 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  40.69 
 
 		 343 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2238  AraC family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 330 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.390455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 341 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  40.26 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2234  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 335 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>