More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42390 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  100 
 
 		 278 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0050  thermoregulatory protein LcrF  56.87 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.24501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  43.75 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  42.76 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3749  helix-turn-helix domain-containing protein  27.35 
 
 		 272 aa  99.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5908  transcriptional regulator, AraC family  27.98 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5386  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  25.85 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4462  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.981211  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3677  transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.627004  normal  0.14963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1515  transcriptional regulator, AraC family  25.83 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1958  helix-turn-helix domain-containing protein  32.32 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2262  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0924  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489543  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3893  helix-turn-helix domain-containing protein  24.7 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5555  transcriptional regulator, AraC family  26.27 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.417705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  24.3 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3940  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.423213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3827  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3914  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  26.94 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1991  helix-turn-helix domain-containing protein  22.63 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4790  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.46 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.654902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6017  transcriptional regulator, AraC family  22.98 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1748  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.63 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6177  transcriptional regulator, AraC family  23.98 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0365179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2476  transcriptional regulator, AraC family  25.21 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0123  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator (AraC family)  22.53 
 
 		 292 aa  72  0.000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.855779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 254 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1303  transcriptional regulator, AraC family  31.09 
 
 		 129 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.239353  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4307  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4000  helix-turn-helix domain-containing protein  22.18 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1299  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2357  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1112  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  28.29 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  26.58 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3385  transcriptional regulator, AraC family  23.51 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 1201 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2283  transcriptional regulator, AraC family  27.4 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0900  transcriptional regulator, AraC family  22.88 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899856  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  33.68 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6018  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  37.93 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0605  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5462  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.265033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4367  transcriptional regulator, AraC family  23.37 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  34.65 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3564  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  31.31 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2210  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  31.31 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4437  transcriptional activator RhaS  31.25 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  26.71 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  30.48 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03791  DNA-binding transcriptional activator, L-rhamnose-binding  30.21 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03740  hypothetical protein  30.21 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  31.96 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  31.96 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4585  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0477904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5358  transcriptional activator RhaS  30.21 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 150 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 154 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  31.96 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  31.96 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  31.96 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  31.96 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4135  transcriptional activator RhaS  30.21 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4079  transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  25.35 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  23.79 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  25.87 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4297  transcriptional activator RhaS  30.21 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>