More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3749 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3749  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  563  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  90.07 
 
 		 272 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3893  helix-turn-helix domain-containing protein  78.89 
 
 		 272 aa  449  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6017  transcriptional regulator, AraC family  67.29 
 
 		 270 aa  374  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1748  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  62.5 
 
 		 270 aa  357  8e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6018  transcriptional regulator, AraC family  59.02 
 
 		 267 aa  328  9e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1515  transcriptional regulator, AraC family  55.3 
 
 		 265 aa  325  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5386  transcriptional regulator, AraC family  53.23 
 
 		 270 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4462  transcriptional regulator, AraC family  52.69 
 
 		 271 aa  278  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.981211  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3802  Helix-turn-helix, AraC domain protein  50.84 
 
 		 264 aa  265  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00633295  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0924  transcriptional regulator, AraC family  51.65 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489543  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4000  helix-turn-helix domain-containing protein  41.04 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4790  Helix-turn-helix, AraC domain protein  39.38 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.654902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5555  transcriptional regulator, AraC family  41.42 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.417705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3385  transcriptional regulator, AraC family  39.3 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5700  transcriptional regulator, AraC family  37.98 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.554273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6177  transcriptional regulator, AraC family  36.92 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0365179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0900  transcriptional regulator, AraC family  36.22 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899856  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1112  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4456  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0480733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0605  transcriptional regulator, AraC family  36.68 
 
 		 269 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5462  transcriptional regulator, AraC family  36.13 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.265033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3141  transcriptional regulator, AraC family  35.95 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0156  helix-turn-helix domain-containing protein  33.59 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00245012  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4142  transcriptional regulator, AraC family  34.68 
 
 		 275 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.776945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5908  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 286 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3677  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.627004  normal  0.14963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  27.35 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4367  transcriptional regulator, AraC family  26.86 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1303  transcriptional regulator, AraC family  43.27 
 
 		 129 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.239353  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  24.23 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4585  transcriptional regulator, AraC family  35.17 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0477904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1991  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  23.79 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6783  transcriptional regulator, AraC family  24.51 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2476  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  26.74 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  23.55 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0050  thermoregulatory protein LcrF  24.53 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.24501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  37.18 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0123  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator (AraC family)  25.1 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.855779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  33.64 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  28.37 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  30.93 
 
 		 387 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  29.79 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  30.16 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1186  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0079  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1063  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.81783  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  26.04 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0094  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1958  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2262  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  27.03 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1500  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.546441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  24.91 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0188  transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000327  transcriptional regulator AraC family  29.9 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000791228  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2402  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4066  transcriptional activator RhaS  29.9 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.828841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7250  transcriptional regulator AraC family  30.85 
 
 		 332 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2161  AraC family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  24.11 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1287  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.84 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  30.93 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3282  helix-turn-helix domain-containing protein  23.31 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3526  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382139  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2248  helix-turn-helix domain-containing protein  26.04 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3228  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  28.72 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 361 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2227  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>