More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1186 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1186  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  594  1e-169  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1063  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  594  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.81783  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0123  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator (AraC family)  39.06 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.855779  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3677  transcriptional regulator, AraC family  29.72 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.627004  normal  0.14963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5908  transcriptional regulator, AraC family  25.52 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2476  transcriptional regulator, AraC family  25.29 
 
 		 286 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  22.84 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1287  AraC family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 81 aa  86.3  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  24.56 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1991  helix-turn-helix domain-containing protein  24.21 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6783  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  26.37 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1303  transcriptional regulator, AraC family  39.53 
 
 		 129 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.239353  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  32.56 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4142  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.776945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  20.25 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5386  transcriptional regulator, AraC family  23.55 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4456  transcriptional regulator, AraC family  20.66 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0480733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1748  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.19 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.89 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  28 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5700  transcriptional regulator, AraC family  21.58 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.554273 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3141  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  24.84 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  31.4 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  31.03 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 150 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 150 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 150 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  27.62 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  32.35 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  23.7 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4585  transcriptional regulator, AraC family  22.57 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0477904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3385  transcriptional regulator, AraC family  23.67 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1112  transcriptional regulator, AraC family  23.2 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0886  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  29.89 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6177  transcriptional regulator, AraC family  24.43 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0365179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3749  helix-turn-helix domain-containing protein  27.71 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3893  helix-turn-helix domain-containing protein  26.97 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  30.09 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5462  transcriptional regulator, AraC family  22.05 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.265033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  25.29 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  21.13 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 678 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  30.59 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4462  transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.981211  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  25.29 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5555  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.417705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0441  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 188 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.586724  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0924  transcriptional regulator, AraC family  25.32 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489543  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0050  thermoregulatory protein LcrF  35.29 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.24501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1515  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0900  transcriptional regulator, AraC family  18.75 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899856  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  29.91 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>