More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2262 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2262  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  486  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1958  helix-turn-helix domain-containing protein  93.53 
 
 		 232 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3940  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.423213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3914  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3827  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0050  thermoregulatory protein LcrF  34.34 
 
 		 271 aa  85.9  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.24501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  30.3 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  32.32 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  28.28 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 136 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 337 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2940  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 565 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91789  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2820  alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 		 565 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1557  transcriptional regulator, AraC family  42.17 
 
 		 565 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.486878  hitchhiker  0.00513105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2800  alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 		 565 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6177  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0365179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2497  alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 		 563 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4462  transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.981211  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0872  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 382 aa  62.4  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2357  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 332 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  30.21 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3127  Ada regulatory protein, putative  39.76 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2560  Ada metal-binding domain-containing protein  43.21 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3893  helix-turn-helix domain-containing protein  28.87 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6017  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1367  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  34.31 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.987326  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6432  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1557  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  32.63 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0341  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.729431 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  30.69 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2924  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817827  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1004  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  28.83 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4142  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.776945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2823  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  41.46 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3564  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3749  helix-turn-helix domain-containing protein  30.93 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3056  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.351096  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4290  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2063  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1219  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 492 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.627471  normal  0.0317838 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0885  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1415  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1891  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0574  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.389496  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2199  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0477  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.555067  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1432  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  38.55 
 
 		 542 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.587102 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1507  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1420  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.55 
 
 		 542 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.484928 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0100  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4961  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0263791 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5196  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82206  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3060  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4668  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.622787 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5307  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1788  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 350 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 339 aa  58.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3416  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0904858  normal  0.667905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5386  transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7106  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4671  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2210  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 295 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1738  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2126  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 346 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.330362  normal  0.517633 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0590  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.988044  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0924  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489543  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2849  AraC family transcription regulator  34.04 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2428  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1774  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1156  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 346 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.131612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  30.06 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0541  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 341 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.514345  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1178  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 346 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2788  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>