More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_B0050 on replicon NC_010157
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0050  thermoregulatory protein LcrF  100 
 
 		 271 aa  552  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.24501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  56.87 
 
 		 278 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  41.86 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  42.25 
 
 		 286 aa  198  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3677  transcriptional regulator, AraC family  24.58 
 
 		 282 aa  89  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.627004  normal  0.14963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2262  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 232 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1958  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 232 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5908  transcriptional regulator, AraC family  24.69 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  26.91 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3914  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3827  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3940  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.423213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5386  transcriptional regulator, AraC family  24.48 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3893  helix-turn-helix domain-containing protein  26.49 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3749  helix-turn-helix domain-containing protein  25.1 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6017  transcriptional regulator, AraC family  21.7 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1515  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4462  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.981211  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4367  transcriptional regulator, AraC family  24.02 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1991  helix-turn-helix domain-containing protein  26.88 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6177  transcriptional regulator, AraC family  25.58 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0365179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0924  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489543  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6783  transcriptional regulator, AraC family  27.23 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0123  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator (AraC family)  24.1 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.855779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1299  transcriptional regulator, AraC family  26.14 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1748  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.31 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  23.23 
 
 		 272 aa  72  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3802  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.71 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00633295  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0886  transcriptional regulator, AraC family  25.4 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6018  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2476  transcriptional regulator, AraC family  24.1 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1303  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.239353  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1112  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  31.02 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  36.46 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  26.01 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  29.25 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  35.35 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5912  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0900  transcriptional regulator, AraC family  22.92 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899856  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  32.29 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2599  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4585  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0477904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  31.18 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  25.29 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02883  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.9 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0689  transcriptional regulator, AraC family  26.9 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3437  transcriptional regulator, AraC family  26.9 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.833762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3189  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.98 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0686  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3294  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5555  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.417705 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3478  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4790  Helix-turn-helix, AraC domain protein  31.91 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.654902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02833  hypothetical protein  26.9 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4142  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.776945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0605  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>