More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1991 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1991  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2476  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 286 aa  185  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6783  transcriptional regulator, AraC family  36.03 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3677  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.627004  normal  0.14963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5908  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 		 286 aa  118  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4456  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 		 261 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0480733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5386  transcriptional regulator, AraC family  25.4 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1748  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.38 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0924  transcriptional regulator, AraC family  24.69 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489543  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1515  transcriptional regulator, AraC family  25.31 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4790  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.55 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.654902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0900  transcriptional regulator, AraC family  24.02 
 
 		 269 aa  95.9  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899856  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1112  transcriptional regulator, AraC family  26.34 
 
 		 268 aa  95.5  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0605  transcriptional regulator, AraC family  50.63 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3893  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5462  transcriptional regulator, AraC family  22.62 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.265033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  41.3 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3749  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3802  Helix-turn-helix, AraC domain protein  39.36 
 
 		 264 aa  85.5  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00633295  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5700  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 269 aa  85.5  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.554273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4462  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 271 aa  85.5  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.981211  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3385  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5555  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.417705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6017  transcriptional regulator, AraC family  21.51 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6018  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1186  AraC family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1063  AraC family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.81783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3141  transcriptional regulator, AraC family  23.2 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4000  helix-turn-helix domain-containing protein  25.2 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0156  helix-turn-helix domain-containing protein  24 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00245012  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0123  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator (AraC family)  26.54 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.855779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  22.04 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4142  transcriptional regulator, AraC family  24.27 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.776945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  23.79 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1303  transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.239353  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  22.63 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4585  transcriptional regulator, AraC family  21.38 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0477904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  24.7 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3775  AraC-like transcriptional regulator  23.44 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6177  transcriptional regulator, AraC family  35.44 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0365179 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0050  thermoregulatory protein LcrF  31.86 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.24501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1284  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.960401  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1163  AraC-type transcriptional regulator domain protein  25.59 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000040891  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0109  AraC-like transcriptional regulator  23.9 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  hitchhiker  0.00915457 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0536  transcriptional regulator  26.9 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3137  AraC family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02883  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.37 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0689  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3189  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3478  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3437  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.833762  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3294  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02833  hypothetical protein  29.37 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2256  AraC family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0686  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4320  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3228  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  25.42 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  29.75 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1753  AraC family transcriptional regulator  20.31 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143469  normal  0.226934 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000211  transcriptional regulator AraC family  25.71 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0526  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3330  AraC-like transcriptional regulator  23.9 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  22.78 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3420  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1095  transcriptional regulator, AraC-family  22.61 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  29.55 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  30.68 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3074  transcriptional regulator, AraC family  21.37 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.618991  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4929  transcriptional regulator, AraC family  20.31 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202383  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2924  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817827  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1557  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2271  transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2008  transcriptional regulator, AraC family  21.26 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232037  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32460  transciption regulator, AraC-family  22.86 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2895  AraC family transcriptional regulator  20.61 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.130917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 150 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3673  AraC family transcriptional regulator  19.85 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  21.62 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 150 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 150 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>