More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1287 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1287  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 81 aa  164  5e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00907942  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0123  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator (AraC family)  60.49 
 
 		 292 aa  105  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.855779  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1186  AraC family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 296 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1063  AraC family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 296 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.81783  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1303  transcriptional regulator, AraC family  40.28 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.239353  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3677  transcriptional regulator, AraC family  42.42 
 
 		 282 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.627004  normal  0.14963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5908  transcriptional regulator, AraC family  36.23 
 
 		 286 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 287 aa  62  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3893  helix-turn-helix domain-containing protein  32.89 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1748  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39.13 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  31.58 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 285 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.43 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3749  helix-turn-helix domain-containing protein  37.84 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6177  transcriptional regulator, AraC family  39.71 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0365179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0827  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000316121  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0050  thermoregulatory protein LcrF  33.33 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.24501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0116  transcriptional regulator, AraC family  37.31 
 
 		 351 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1991  helix-turn-helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 284 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1515  transcriptional regulator, AraC family  33.82 
 
 		 265 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 333 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4000  helix-turn-helix domain-containing protein  36.23 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  38.81 
 
 		 309 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1299  transcriptional regulator, AraC family  29.33 
 
 		 334 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 522 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4142  transcriptional regulator, AraC family  36.23 
 
 		 275 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.776945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  36.49 
 
 		 1384 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 341 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 300 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 322 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 304 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1960  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2888  AraC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 286 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0357518  hitchhiker  0.0034345 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 291 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3826  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 307 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.753921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  28.99 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 296 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  35.62 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 282 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  28.38 
 
 		 241 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 316 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 286 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5555  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 271 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.417705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 287 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  28.38 
 
 		 286 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  27.4 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  27.54 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  27.4 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  30.38 
 
 		 310 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4367  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 286 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  37.14 
 
 		 1373 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 284 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 513 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4462  transcriptional regulator, AraC family  34.25 
 
 		 271 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.981211  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  30.43 
 
 		 291 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 293 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  31.88 
 
 		 324 aa  50.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 363 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 		 290 aa  50.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  27.4 
 
 		 286 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 291 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 301 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3015  transcriptional regulator  30 
 
 		 283 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.103584  normal  0.15969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  31.94 
 
 		 293 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 		 296 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1440  helix-turn-helix, AraC type  35.71 
 
 		 209 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 934 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 297 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  26.03 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 287 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6017  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 270 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  27.4 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5642  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 308 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  32.88 
 
 		 961 aa  49.7  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 314 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4790  Helix-turn-helix, AraC domain protein  31.88 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.654902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 326 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 282 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 306 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0392  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 234 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 339 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  27.03 
 
 		 327 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2099  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.79 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0478327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 289 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2833  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360969  hitchhiker  0.00326998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4999  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 279 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 293 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>