88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2161 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2161  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  618  1e-176  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3749  helix-turn-helix domain-containing protein  24.47 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  30 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  27.33 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  22.71 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  27.27 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 326 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3677  transcriptional regulator, AraC family  22.63 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.627004  normal  0.14963 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  32.53 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2476  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0050  thermoregulatory protein LcrF  27.66 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.24501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2481  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25538 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3385  transcriptional regulator, AraC family  22.58 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3893  helix-turn-helix domain-containing protein  21.28 
 
 		 272 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2210  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3564  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0924  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489543  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4153  transcriptional regulator, AraC family  28.41 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6018  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1991  helix-turn-helix domain-containing protein  23.48 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  27.96 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  29.35 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  30.11 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1748  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.72 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1112  transcriptional regulator, AraC family  23.38 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  30.11 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0814  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 343 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3288  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  28.08 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575953  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1294  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0435473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1101  Ada metal-binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 511 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12283  normal  0.610277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1299  transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0188  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  31 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5700  transcriptional regulator, AraC family  24.53 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.554273 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  29.76 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  22.18 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  21.46 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  28.75 
 
 		 530 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  29.47 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  29.03 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  29.27 
 
 		 350 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 372 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  28.75 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0123  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator (AraC family)  22.64 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.855779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  31.65 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6017  transcriptional regulator, AraC family  21.69 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  26 
 
 		 427 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  30.49 
 
 		 316 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2855  AraC family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 258 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 285 aa  42.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  24.39 
 
 		 315 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  24.82 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  29.03 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6130  transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 269 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>