More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0123 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0123  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator (AraC family)  100 
 
 		 292 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.855779  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1186  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1063  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.81783  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3677  transcriptional regulator, AraC family  32.27 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.627004  normal  0.14963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5908  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 286 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1287  AraC family transcriptional regulator  60.49 
 
 		 81 aa  105  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6783  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1991  helix-turn-helix domain-containing protein  26.54 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1112  transcriptional regulator, AraC family  26.72 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  22.88 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  22.53 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  22.49 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5462  transcriptional regulator, AraC family  24.51 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.265033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3893  helix-turn-helix domain-containing protein  24.81 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6177  transcriptional regulator, AraC family  25.38 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0365179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1748  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.79 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3749  helix-turn-helix domain-containing protein  25.1 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0900  transcriptional regulator, AraC family  24.15 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899856  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4142  transcriptional regulator, AraC family  23.35 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.776945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  24.71 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5386  transcriptional regulator, AraC family  26.12 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0924  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489543  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5700  transcriptional regulator, AraC family  26.29 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.554273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6017  transcriptional regulator, AraC family  22.73 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2476  transcriptional regulator, AraC family  22.9 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0441  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 188 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.586724  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0050  thermoregulatory protein LcrF  24.1 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.24501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  24.41 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111213  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  37.18 
 
 		 144 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2943  helix-turn-helix domain-containing protein  27.7 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0314532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  42.65 
 
 		 1384 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2855  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4456  transcriptional regulator, AraC family  22.13 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0480733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4999  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  29.76 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4619  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  41.27 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  20.08 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  33.77 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  32.53 
 
 		 134 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  32.5 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0285  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000546061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  32.5 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3823  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4000  helix-turn-helix domain-containing protein  25.75 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 156 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 151 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1960  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1303  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.239353  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4367  transcriptional regulator, AraC family  22.09 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  40 
 
 		 1373 aa  56.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.18 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>