297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0330 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0330  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  474  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0278  AraC family transcriptional regulator  55.42 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0215  transcriptional regulator, AraC family  67.76 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0200  AraC family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  37.2 
 
 		 231 aa  93.2  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0910  helix-turn-helix, AraC type  31.42 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  33.61 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  25.31 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  32.64 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  32.64 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  29.96 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0392  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0312  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 255 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1820  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.167781  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  28.4 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  30.18 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  25.54 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  22.27 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5292  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  30.96 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  29.92 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  22.88 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7867  transcriptional regulator, AraC family  28.64 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6332  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1536  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 359 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6509  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6743  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645545  normal  0.349811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  24.12 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 335 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 315 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 282 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4179  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 288 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  21.49 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 		 345 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 319 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  30.53 
 
 		 329 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0591  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 316 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  27.66 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3696  helix-turn-helix domain-containing protein  34.74 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  34.53 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  21.19 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  35.8 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5810  transcriptional regulator, AraC family  41.07 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 340 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 437 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  32.06 
 
 		 326 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 313 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 363 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 275 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  23.87 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  26.53 
 
 		 332 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 328 aa  49.3  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 279 aa  48.9  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3499  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 281 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0453  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 281 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 		 325 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 351 aa  48.9  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 330 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>