203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0200 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0200  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  448  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0215  transcriptional regulator, AraC family  99.14 
 
 		 233 aa  441  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0330  AraC family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 242 aa  255  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0278  AraC family transcriptional regulator  57.98 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 254 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0312  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1820  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.167781  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0910  helix-turn-helix, AraC type  28.51 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  25.71 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  31.22 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  31.22 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  22.18 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  22.78 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0392  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  28.1 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 255 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4999  AraC family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 279 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  26.54 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4886  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  25.74 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1536  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 359 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  28.76 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  37.11 
 
 		 328 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 325 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  20.09 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 253 aa  52.4  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  27.47 
 
 		 305 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 313 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 335 aa  51.6  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  28.27 
 
 		 295 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  24.89 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  22.61 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 297 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7867  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 356 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 273 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 325 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 325 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 277 aa  48.5  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 266 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 266 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0117  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4732  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 320 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4179  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 320 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 335 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  35.53 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2766  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 344 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  31.31 
 
 		 329 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2035  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 318 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>