More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3696 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3696  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 188 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 319 aa  198  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0591  AraC family transcriptional regulator  55.76 
 
 		 316 aa  189  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 303 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 305 aa  104  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  31.93 
 
 		 297 aa  95.9  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 305 aa  95.1  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  38.57 
 
 		 250 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 249 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  37.86 
 
 		 250 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 299 aa  89  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 291 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 322 aa  84.3  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  36.59 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 311 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  39.25 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  33.83 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  44.21 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 322 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 315 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 332 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 327 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  34.29 
 
 		 289 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 678 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  38.94 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  30.37 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  27.75 
 
 		 296 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 293 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 304 aa  72  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 324 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 329 aa  72  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 299 aa  71.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 300 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 293 aa  71.6  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  27.46 
 
 		 308 aa  71.2  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 287 aa  71.2  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  29.17 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  32.43 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  0.0000000035636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  34.41 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  30.56 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  36.28 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  33.93 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 329 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  32.86 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 324 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4458  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 446 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  36.46 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 301 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 256 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6738  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 333 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  30.37 
 
 		 312 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 278 aa  67.8  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31.2 
 
 		 1201 aa  67.8  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>