More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2618 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2618  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2470  hypothetical protein  98.41 
 
 		 251 aa  517  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4999  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 239 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  28.1 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  25.41 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3546  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  36.45 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  24.1 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  23.29 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  23.39 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  27.19 
 
 		 240 aa  72  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  27.95 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00477  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.69 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0851  helix-turn-helix domain-containing protein  33.66 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0269486 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 539 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  39.56 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3282  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 307 aa  68.6  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0910  helix-turn-helix, AraC type  25.71 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  34.17 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2404  AraC family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 330 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  33 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.88 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.8 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.8 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.8 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.8 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.8 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.8 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.49 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  30.3 
 
 		 141 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 118 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  36 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  27.69 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  27.73 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3759  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.831602  hitchhiker  0.00901781 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  36 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  26.05 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  22.36 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  22.36 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  23.05 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3720  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44403  normal  0.422333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1004  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.06 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  31.33 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2748  AraC family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 275 aa  62  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 147 aa  62  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4483  AraC-like transcriptional regulator  32.26 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000135378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3314  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 236 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2399  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4276  AraC family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>