More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5321 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 260 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  95.38 
 
 		 287 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  76.52 
 
 		 278 aa  359  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  73.68 
 
 		 256 aa  347  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  71.6 
 
 		 256 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  68.31 
 
 		 257 aa  328  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  68.31 
 
 		 257 aa  328  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  40.3 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  34.76 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  35.98 
 
 		 257 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  37.78 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  29.88 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  35.47 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  34.14 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  31.88 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3351  Helix-turn-helix, AraC domain protein  34.29 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 228 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  30.08 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  33.63 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02039  putative DNA-binding protein  28.63 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0671  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2303  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  43.18 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2432  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28452  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3822  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1743  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295048  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  29.66 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  32.02 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3877  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2201  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3263  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.534649  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  41.33 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15970  transcriptional regulator, AraC family  39.44 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193936 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  33.62 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  34.65 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3204  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19869  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3418  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 97 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6130  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1998  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.05 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  42.17 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 330 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  30.09 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 143 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8405  transcriptional regulator, AraC family  40.7 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 360 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 355 aa  52.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 360 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 360 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 360 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 151 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 223 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 357 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4441  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.440571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 351 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  36.89 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 131 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2462  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 143 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4074  helix-turn-helix domain-containing protein  36.47 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 410 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  36.7 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 143 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7439  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  29.88 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 356 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  34.72 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 357 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 357 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 393 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  36.78 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  32.1 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 315 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 308 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>