189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2317 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  473  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  32.62 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  32.92 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 262 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  32.24 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  28.63 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 		 264 aa  85.5  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2303  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  30.49 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  41.12 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  34.48 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02039  putative DNA-binding protein  24.7 
 
 		 249 aa  72  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3877  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  37.25 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  45.21 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  39.09 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3822  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 288 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3351  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.28 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1998  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.16 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 276 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1743  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295048  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15970  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  34.26 
 
 		 278 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  30 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 306 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 306 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 306 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 351 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  28.92 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.11 
 
 		 415 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 284 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  27.7 
 
 		 303 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2201  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  30.17 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2432  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28452  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2427  AraC family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3263  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.534649  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 275 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 299 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2973  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 127 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 264 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 294 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1490  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107689  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  35.21 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  35.21 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 299 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 296 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 296 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 312 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 305 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 151 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 305 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 143 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 305 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 143 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  33.8 
 
 		 296 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1112  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 296 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  26.79 
 
 		 310 aa  45.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 296 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 305 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>