More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3162 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  69.68 
 
 		 318 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  70.86 
 
 		 314 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  64.6 
 
 		 305 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  64.23 
 
 		 305 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  64.23 
 
 		 305 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  63.5 
 
 		 305 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  62.81 
 
 		 301 aa  359  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  63.87 
 
 		 301 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 312 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  61.72 
 
 		 299 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  61.72 
 
 		 299 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  44.93 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6198  transcriptional regulator, AraC family  47.24 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  43.97 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  30.24 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  25.74 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  31.17 
 
 		 293 aa  92  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 289 aa  92  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  39.86 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  34.87 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 361 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  26.74 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  40.31 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 319 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  29.38 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  30.59 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2369  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  26.55 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  29.86 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  32.7 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  42.24 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  44.57 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  42.55 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  28.85 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  30.07 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  30.25 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  23.44 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  30.06 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  23.44 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  23.44 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4449  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.943681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6584  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  37.11 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  29.38 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  29.08 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4074  helix-turn-helix domain-containing protein  32.68 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1502  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 115 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182478  normal  0.0194008 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 131 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  35.59 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>