More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3649 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 256 aa  490  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  81.03 
 
 		 256 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  80 
 
 		 278 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  73.25 
 
 		 257 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  73.25 
 
 		 257 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  73.68 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  73.97 
 
 		 287 aa  326  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  39.93 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  42.04 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  36.91 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  37.84 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3351  Helix-turn-helix, AraC domain protein  35.46 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  35.68 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  28.46 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 288 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  47.06 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3877  transcriptional regulator, AraC family  38.33 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  34.51 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2303  AraC family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3822  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  48.1 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02039  putative DNA-binding protein  27.23 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1743  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295048  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  42.27 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  45.74 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0671  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1998  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.11 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2432  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28452  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15970  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3263  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.534649  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2201  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 151 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3204  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19869  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  29.69 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6130  transcriptional regulator, AraC family  46.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 294 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2462  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 337 aa  52.8  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 151 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1788  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 350 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 299 aa  52  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4290  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 347 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1156  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 346 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.131612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8405  transcriptional regulator, AraC family  40.7 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0699  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 346 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  31.76 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1178  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 346 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1738  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0590  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.988044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2788  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2849  AraC family transcription regulator  31.19 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2863  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1774  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2126  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.330362  normal  0.517633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2924  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 349 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817827  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1557  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 349 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1060  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1057  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0171524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2729  AraC family transcription regulator  31.19 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  33.1 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2428  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.31 
 
 		 415 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 351 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 363 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 360 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>