More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8405 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8405  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 273 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4352  transcriptional regulator, AraC family  49.81 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00646909  normal  0.121153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6130  transcriptional regulator, AraC family  37.3 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3152  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2080  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1151  helix-turn-helix domain-containing protein  24.2 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2199  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  hitchhiker  0.00764507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  45.16 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  34.01 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2746  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0693  AraC family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0345  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  23.31 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09710  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  39.58 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.966936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1299  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.736083 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  24.02 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3718  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  42.72 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  37.78 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1551  AraC/XylS family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0639275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  26.53 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  45.12 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  37.18 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  39.81 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  34.75 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  36.05 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  25.86 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  32.2 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 384 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  29.31 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  38.82 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2387  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000368739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  40.45 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2484  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151206  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  42.68 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5109  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0905505  normal  0.0237076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  40.2 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  38.2 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  26.53 
 
 		 408 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 532 aa  56.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  36.14 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  36.67 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 409 aa  55.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0799  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  26.53 
 
 		 408 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  0.0000000035636 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 409 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>