More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4352 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4352  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 274 aa  534  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00646909  normal  0.121153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8405  transcriptional regulator, AraC family  50.19 
 
 		 273 aa  198  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6130  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  41.88 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1151  helix-turn-helix domain-containing protein  31 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3152  transcriptional regulator, AraC family  29.1 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2199  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  hitchhiker  0.00764507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5109  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0905505  normal  0.0237076 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2080  transcriptional regulator, AraC family  42.05 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  22.56 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  36.14 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0345  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3718  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  27.71 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  23.76 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  23.76 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0693  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  32.64 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  26.6 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  30.22 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3295  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 508 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  40.2 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  41 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  25.66 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2746  transcriptional regulator, AraC family  34.67 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 361 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 515 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  32.53 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  26.95 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.29 
 
 		 360 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  41.98 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.11 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  25.74 
 
 		 513 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 533 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4722  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 360 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 329 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1299  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.736083 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  26.67 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  40.24 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  27.88 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  33.65 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 393 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  25.25 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 284 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4910  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 388 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 285 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  22.64 
 
 		 542 aa  52.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 299 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  21.3 
 
 		 343 aa  52.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  33.73 
 
 		 299 aa  52.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 360 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>