More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3877 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3877  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 282 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3822  AraC family transcriptional regulator  87.59 
 
 		 282 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  38.85 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  33.99 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  33.04 
 
 		 273 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  32.59 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  32.81 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 233 aa  90.5  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  49.37 
 
 		 264 aa  89.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  31.09 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  35.9 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  29.82 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1998  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.5 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  29.8 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  44.05 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15970  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1743  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295048  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2303  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  31.9 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  47.89 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3351  Helix-turn-helix, AraC domain protein  38.89 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0671  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  31.13 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 533 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  29.76 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5828  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  38.83 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  31.73 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53090  transcriptional regulator  30.42 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02039  putative DNA-binding protein  22.75 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  37.21 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3718  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  40.71 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  40.26 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  25 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4555  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3514  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  26.89 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3159  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0609208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>