244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0671 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0671  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3204  AraC family transcriptional regulator  59.2 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19869  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2432  transcriptional regulator, AraC family  59.13 
 
 		 274 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2201  AraC family transcriptional regulator  59.45 
 
 		 275 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3263  AraC family transcriptional regulator  57.94 
 
 		 274 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.534649  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  48.21 
 
 		 276 aa  204  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  28.14 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  28.33 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  28.03 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  29.81 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  34.65 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  26.4 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  31.9 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  27.57 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1743  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295048  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 228 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3822  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  26.98 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 450 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  25.41 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 351 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  24.11 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  25.65 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 330 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.29 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.24 
 
 		 310 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3877  transcriptional regulator, AraC family  25.54 
 
 		 282 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.13 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2731  Helix-turn-helix, AraC domain protein  32.11 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02039  putative DNA-binding protein  22.51 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3718  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  21.55 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  30.69 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.73 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 143 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 143 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.06 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 333 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 151 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2598  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 320 aa  49.3  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.85 
 
 		 314 aa  49.3  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2303  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  29.63 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3351  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.04 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0360  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000460662  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 143 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  26.18 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  26.53 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0116  transcriptional regulator, AraC family  27 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  25.13 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.35 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1802  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1249  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 522 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.35 
 
 		 415 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  24.75 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2978  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 513 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2462  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 337 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 324 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  29.82 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0723  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 331 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.065718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>