228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_15970 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_15970  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1998  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.67 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  25.45 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  26.47 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  21.61 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  42.62 
 
 		 269 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  32.79 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3822  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  39.44 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  39.44 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3877  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1172  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.324704  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0616  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  26.05 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  29.33 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2282  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 345 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1666  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 1121 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  30.36 
 
 		 265 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004105  signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 1125 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  31.91 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01362  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1141 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0565  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0345  helix-turn-helix domain-containing protein  22.97 
 
 		 305 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2938  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 357 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1743  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 285 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295048  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 151 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.57 
 
 		 292 aa  48.9  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3282  helix-turn-helix domain-containing protein  28 
 
 		 307 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  31.94 
 
 		 221 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2396  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  29.23 
 
 		 343 aa  48.9  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.57 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.57 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8405  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 273 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3365  methylated-DNA-[protein]-cysteine S-methyltransferase  24.19 
 
 		 384 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2856  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 361 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.2 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.57 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37190  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  30.93 
 
 		 358 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.57 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.57 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3229  AraC family transcriptional regulator  21.15 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0822479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5551  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 133 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0721  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  34.18 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  24.09 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  22.56 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  25.64 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3204  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19869  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2432  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 345 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 305 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  35.94 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  30.95 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2450  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 361 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3351  Helix-turn-helix, AraC domain protein  22.73 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2570  bifunctional methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase/O-6-methylguanine-DNA transcription regulator  32.53 
 
 		 360 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3190  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  31.52 
 
 		 358 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 288 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 357 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 310 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  32.86 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.79 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>