86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1998 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1998  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  100 
 
 		 258 aa  535  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15970  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  34.19 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3877  transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  25.5 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3822  AraC family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  24.47 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  25.11 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  22.83 
 
 		 287 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  23.05 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2731  Helix-turn-helix, AraC domain protein  32.74 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 223 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  26.89 
 
 		 229 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1743  AraC family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295048  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1172  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.324704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  24.61 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  28.83 
 
 		 295 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  29 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  36.99 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2608  regulatory protein ada  32.11 
 
 		 352 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.669578 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1666  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 1121 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3145  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 365 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198948  unclonable  0.00000000000612342 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2352  regulatory protein Ada  30.37 
 
 		 354 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.970088  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 285 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6508  bifunctional DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  27.43 
 
 		 363 aa  45.4  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000013299  normal  0.0946299 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2539  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 363 aa  45.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000057895  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3152  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 363 aa  45.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000475647  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2491  regulatory protein ada  31.19 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2505  regulatory protein ada  31.19 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.899315  hitchhiker  0.000630655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2401  regulatory protein ada  31.19 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00982046  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2449  regulatory protein ada  31.19 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0458356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4835  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 360 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179003  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02099  hypothetical protein  29.63 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.592554  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3089  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000381417  hitchhiker  0.0021619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02140  fused DNA-binding transcriptional dual regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase  29.63 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.581837  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3205  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 380 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000040374  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2836  ADA regulatory protein  28.89 
 
 		 364 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000994394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2249  ADA regulatory protein  28.89 
 
 		 364 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000255362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3171  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000719173  decreased coverage  0.000000135353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2118  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0669009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0116  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  28.89 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327978  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0132  ADA regulatory protein  28.89 
 
 		 364 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622499  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2300  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  28.89 
 
 		 364 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000121844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2323  ADA regulatory protein  28.89 
 
 		 364 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00000161007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0115  ADA regulatory protein  28.89 
 
 		 364 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000393468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0322  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  28.89 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000161378  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5828  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3351  regulatory protein Ada  29.52 
 
 		 354 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.212963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004105  signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 1125 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01362  hypothetical protein  31.88 
 
 		 1141 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2512  regulatory protein Ada  31.13 
 
 		 354 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0107303  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1445  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 354 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.29559  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0727  regulatory protein Ada  31.13 
 
 		 354 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.166972  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2338  AraC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1437  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 354 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2362  regulatory protein Ada  31.13 
 
 		 354 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.960218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3110  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 189 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0085  ADA regulatory protein  28.95 
 
 		 364 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911419  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.23 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  34.85 
 
 		 234 aa  42  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 		 255 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>