More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5245 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
312 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  83.93 
 
 
305 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  83.93 
 
 
305 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  83.28 
 
 
305 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  84.05 
 
 
305 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  83.5 
 
 
301 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  83.5 
 
 
301 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  59.74 
 
 
318 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  59.8 
 
 
314 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  65.22 
 
 
285 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  61.51 
 
 
299 aa  321  8e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  61.51 
 
 
299 aa  321  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  47.1 
 
 
298 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6198  transcriptional regulator, AraC family  50.54 
 
 
285 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  49.79 
 
 
278 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 
309 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 
304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 
291 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  31.6 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 
312 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 
353 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  32.55 
 
 
291 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 
291 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 
291 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  30.83 
 
 
289 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  31.88 
 
 
295 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
293 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  31.49 
 
 
294 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  28.14 
 
 
289 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  38.56 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 
288 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  36.48 
 
 
287 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 
293 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 
294 aa  92.4  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  30.59 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 
361 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 
287 aa  89  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  31.45 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.8 
 
 
287 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
299 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
311 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  37.32 
 
 
293 aa  85.9  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  26.72 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  27.73 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  30.58 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  35.94 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  23.81 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  23.81 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  23.81 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  23.81 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  28.73 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 
678 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  27.36 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  29.53 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  35.4 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  35.93 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>