More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6584 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6584  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1502  AraC family transcriptional regulator  75.49 
 
 		 115 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182478  normal  0.0194008 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6083  transcriptional regulator, AraC family  73.79 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.864918 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  53 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  53 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0792  AraC family transcriptional regulator  54 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3070  helix-turn-helix domain-containing protein  47.62 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362329  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0046  AraC family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  45.16 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 299 aa  80.5  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 277 aa  80.5  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  40.43 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  41.05 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 278 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  38.38 
 
 		 294 aa  77  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 311 aa  77  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1112  transcriptional regulator, AraC family  40.54 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  37.63 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  40.66 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 314 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 305 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 301 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 301 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 267 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 272 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  41.58 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  42.17 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  41.58 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 312 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 277 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 287 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 336 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 312 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 300 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0973  transcriptional regulator, AraC family  40.45 
 
 		 260 aa  70.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 312 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 316 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 270 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  41.11 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  43.18 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  39.6 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  43.9 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6455  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  42.17 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  40.23 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 299 aa  68.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 281 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 306 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 294 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 250 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  38 
 
 		 273 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 281 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 290 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 292 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 291 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 250 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 290 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 278 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 271 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 278 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  33.98 
 
 		 291 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  37.11 
 
 		 293 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 275 aa  67  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 305 aa  67  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 276 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>