More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2318 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 256 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.8 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  24.5 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  27.62 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  28.19 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  32.4 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.92 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  26.8 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 297 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  26.4 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  27.07 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  40.59 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  24.54 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  25.29 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  35.85 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39.53 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  26.59 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  24.04 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  28.25 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  26.82 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  40.51 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  28.07 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.32 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 462 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  41.98 
 
 		 396 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 396 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 410 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 123 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  39.33 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.25 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  22.53 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5154  helix-turn-helix domain-containing protein  37.97 
 
 		 120 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  28.12 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5244  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1655  hypothetical protein  25 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.1 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2336  hypothetical protein  32.22 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.429257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  39.51 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  35.71 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3708  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  27.27 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  38.75 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  40 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6455  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2746  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  40.51 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  21 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>