More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4510 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 268 aa  534  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  45.59 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 271 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 297 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  38.66 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  37.98 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  37.4 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  35.47 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  34.24 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 		 278 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  31.41 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.39 
 
 		 325 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  32.85 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.6 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.33 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.72 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  24.12 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  25.66 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  25.76 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  25.45 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  19.46 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  22.48 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  26.13 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0974  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  22.02 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  40.26 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6197  transcriptional regulator, AraC family  44.19 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  21.62 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  28.25 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.52 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  23.6 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.18 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  24.89 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  39.33 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  22.17 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  39.33 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  24.12 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  34.94 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  24.88 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 356 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 357 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 360 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 357 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  37.82 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 357 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 355 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  37.18 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  31.82 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.79 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.35 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1112  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  26.01 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 310 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 311 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  22.78 
 
 		 327 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 272 aa  52.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>